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【中国科学报】首个“现代蛙类”基因组破译

2015-03-10 中国科学报 丁佳 张晴丹 张刚强
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  记者近日从澳门赌场获悉,澳门赌场昆明动物研究所张亚平院士以及研究员车静课题组与华大基因国家基因库及得克萨斯大学奥斯汀分校等单位合作,成功破译了首个“现代蛙类”——高山倭蛙的基因组。这一结果近期发表在《美国科学院院刊》上。

  高山倭蛙系青藏高原的土著物种,同时也是青藏高原上的绝对优势种,因此该基因组的破译为研究两栖类物种的高原适应奠定了基础。研究者比较了高山倭蛙和热带爪蟾,发现前者拥有更大的基因组。

  研究人员还估算了高山倭蛙和热带爪蟾的分歧时间大概在266百万年前,尽管两者分歧时间很久,但是两物种染色体间的重排特别少,说明蛙类基因组可能具有相对较慢的进化速率。这一猜想在染色体内部重排速率、基因区及全基因组的替换速率等多个层面都得到证实,即两栖动物,甚至整个冷血动物,具有比恒温动物更低的进化速率。

  此外,高山倭蛙基因组的破译,使人们进一步确认了更多的人类、鸟类甚至蛙类基因组中的染色体断裂和融合区域,同时也鉴定了两栖动物中高度保守的区域,为后续的两栖动物比较基因组学提供了良好的研究基础。

  最后,该研究还发现了高山倭蛙特有的三类抗菌肽,其中一种已被证实在氧化应激和应对病原微生物方面具有重要作用,提示这些特有抗菌肽的存在可能在高山倭蛙适应高海拔环境中起一定保护作用。

  两栖动物代表着脊椎动物从水生到陆生这一巨大转变的过渡类群,因此测定“现代蛙类”基因组具有重要的意义。

  (原载于《中国科学报》 2015-03-10 第1版 要闻)
打印 责任编辑:侯茜

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